Tout commence en 1536, lorsque Pedro de Mendoza fonde la ville de Buenos Aires. Dans ses cales, il transporte des chevaux de race ibérique (ancêtres des chevaux andalous et barbes). Cependant, suite aux attaques des populations indigènes et aux famines, la colonie est abandonnée en 1541.

Une poignée de ces chevaux est laissée sur place. Dans les plaines fertiles de la Pampa, ces animaux trouvent un paradis sans prédateurs naturels majeurs. Ils se multiplient de façon exponentielle, formant d'immenses hardes sauvages appelées cimarrónes.

Au fil des siècles, sous la pression de la colonisation humaine et de la chasse, une partie de ces chevaux migre vers le sud, atteignant les régions escarpées et glaciales de la Patagonie et de la Terre de Feu.

C'est ici que le « Bagual » se forge son identité propre. Contrairement au Criollo argentin, qui a été sélectionné par l'homme pour le travail de ranch, le Bagual subit exclusivement la sélection naturelle.

Seuls les individus capables de survivre à des hivers polaires, de se nourrir de végétation rase et coriace, et de naviguer sur des terrains rocheux et escarpés parviennent à se reproduire. Ce processus a créé un équidé d'une rusticité absolue, plus petit et plus trapu que ses ancêtres, doté d'une peau épaisse et d'un instinct de survie aiguisé.

Dans l'histoire argentine, le Bagual occupe une place mythique. Pour le Gaucho, capturer et dompter un bagual représentait le test ultime de courage et de compétence équestre. Cette pratique, appelée la bagualada, consistait à poursuivre ces chevaux sauvages dans les montagnes pour les intégrer aux troupeaux de travail.

L'animal était alors craint pour sa force indomptable et son caractère rebelle. Dans le lexique argentin, le mot « Bagual » est d'ailleurs passé dans le langage courant pour désigner quelqu'un de rustre, de libre ou d'insoumis.

Au XXe siècle, le statut du Bagual a radicalement changé. Avec l'expansion de l'élevage ovin et bovin intensif en Patagonie, ces chevaux sauvages ont commencé à être perçus comme des concurrents pour les pâturages ou des vecteurs de maladies pour le bétail.

Des campagnes d'éradication ont été menées, poussant les populations de Baguales dans les zones les plus inaccessibles des parcs nationaux, comme le Glacier Perito Moreno ou les fjords de la Terre de Feu. Aujourd'hui, ils font l'objet de débats intenses : certains les considèrent comme une espèce invasive à éliminer, tandis que d'autres voient en eux un trésor génétique unique, préservant le sang pur des chevaux ibériques du XVIe siècle, resté intact de tout croisement moderne.