L'étude du Bashkir a révélé que la formation de la race s'est déroulée sur plusieurs siècles.

Il descend de chevaux d'Asie de l'Ouest, sans doute du Tarpan (aujourd'hui disparu), arrivés au VIIème siècle.

Le Bashkir est le résultat d'un élevage traditionnel, par les peuples autochtones de cette région, qui a été mené dans les fermes de la partie sud des Monts Oural en Russie.

Aux XVIIIème et XIXème siècles, le peuple Bachkir se répandit hors de son pays d'origine, et c'est ainsi que ce cheval très robuste fut activement utilisé bien au-delà des frontières de la République de Bachkirie.

Il constituait, par exemple, le principal moyen de transport du service postal en Sibérie occidentale.

Cela semble tout à fait logique, lorsque l'on sait qu'un Bashkir peut se frayer un chemin, avec ses sabots puissants, même à travers une couche de neige épaisse de 1 mètre.

L'ensemble de la région sud des Monts Oural, et plus particulièrement de la République de Bachkirie, se situe dans une zone géographique caractérisée par de difficiles conditions climatiques continentales.

De fortes gelées en hiver, des températures chaudes en été, des vents violents et des tempêtes de neige qui dissimulent la nourriture sous la neige.

C'est cet environnement difficile qui a forgé la race ainsi que les caractéristiques qualitatives transmises par les chevaux de la steppe et de ceux de la forêt du nord.

Même si à une époque, de nombreuses tribus nomades Turques, traversant la République de Bachkirie moderne, ont sans doute amené à des croisements avec des chevaux locaux d'origines diverses, la population existante s'est formée de manière naturelle et n'a pas, ou peu, été changée par l'homme.

Il semblerait toutefois que le Bashkir aurait été croisé avec d'autres races de l'ex-URSS, et qu'il a également été l'objet de croisements expérimentaux avec le Kazakh et le Yakoute.

Au XIXème siècle, sa valeur économique a été reconnue, et des mesures ont été prises pour accroître à la fois ses capacités de travail et ses qualités traditionnelles comme producteur de lait et de viande.

Une étape importante dans la préservation du cheptel du Bashkir a été la construction d'écuries d'état en République de Bachkirie au début du XXème siècle, la création de deux haras, l'organisation de fermes à chevaux dans des collectivités et la création en 1945 d'une zone d'élevage pour les chevaux de la région.

La République de Bachkirie a la troisième plus haute population de chevaux des sujets fédéraux de Russie, après la vallée du la République de l'Altaï et de la République de Sakha.

Au recensement effectué en 2003, l'effectif du Bashkir avoisinait les 94 470 individus.

Il est important de retenir que le Curly, une race des États Unis, n'a pas de lien avec le Bashkir, cela explique sans doute la renonciation, par les américains, de l'appellation « American Bashkir Curly ».