Le pays est intimement lié aux origines du Barut, une lignée du Cheval de Montagne Bosniaque du Haras de Enver Ziga, du Busa, une race éteinte qui est l'ancêtre du Cheval de Montagne Bosniaque, la race la plus populaire sur le territoire, et du Lenkoran, une lignée de l'Arabe utilisée pour améliorer les chevaux de Bosnie Herzégovine.
En ce qui concerne l'élevage de races étrangères, on peut citer, notamment, l'Arabe, une des plus anciennes races du monde et le Lipizzan, une race qui est le parfait exemple du cheval d'équitation baroque.
Tout comme en Croatie, la guerre de l'ex-Yougoslavie a considérablement fait chuter la population équine de la Bosnie Herzégovine. Le pays a vu son cheptel passer de 99 000 individus en 1992 à 14402 sujet, selon le recensement de l'année 2018.