Le socle génétique du Burguete remonte aux populations équines primitives des Pyrénées. Son ancêtre direct est la Jaca Navarra, un petit cheval de montagne, agile et extrêmement résistant, mais de taille réduite. Pendant des siècles, ces chevaux vivaient en semi-liberté, utilisés pour le transport de marchandises à travers les cols de montagne et les travaux agricoles légers.

À la fin du XIXe siècle, les besoins de l'agriculture navarraise évoluent. Les paysans ont besoin de chevaux plus puissants pour labourer des terres plus lourdes et pour répondre à la demande croissante de l'armée en chevaux de trait.

Les éleveurs de la région de Burguete (Auritz) et de Roncesvalles, idéalement situés sur les voies de passage avec la France, commencent à importer des étalons de races de trait françaises renommées. Le métissage s'opère principalement avec :

Le Breton (particulièrement le Postier Breton) : pour la masse et l'énergie.

Le Percheron : pour la taille et la force de traction.

L'Ardennais et le Comtois : pour renforcer la rusticité et la structure osseuse.

Ce brassage génétique, réalisé sur la base robuste de la Jaca Navarra, donne naissance à un type de cheval nouveau : le Burguete. Il conserve l'endurance et l'adaptation au climat rude de ses ancêtres montagnards tout en acquérant la stature d'un véritable cheval de trait.

Au début du XXe siècle, le Burguete s'impose comme la race de trait par excellence en Navarre et dans les régions limitrophes du Pays basque. Il devient essentiel pour le transport du bois dans les forêts de l'Irati et pour les travaux des champs. La race se fixe morphologiquement : un cheval musclé, de taille moyenne, doté d'un tempérament exceptionnellement docile.

Comme toutes les races de trait européennes, le Burguete subit de plein fouet la mécanisation agricole des années 1960. Les tracteurs remplacent les chevaux, et les effectifs s'effondrent.

Pour sauver la race de l'extinction, les éleveurs navarrais opèrent une reconversion radicale vers la production de viande. Le Burguete est alors sélectionné pour sa précocité et sa capacité à produire une viande de haute qualité en pâturant exclusivement en montagne. Ce changement d'usage a permis de maintenir des effectifs viables là où d'autres races ont disparu.

La prise de conscience de la valeur patrimoniale et génétique de la race arrive à la fin du XXe siècle.

1997 : La race est officiellement incluse dans le Catalogue Officiel des Races de Bétail d'Espagne.

Années 2000 : Création de l'ASCABU (Association des Éleveurs de Chevaux de Race Burguete) pour gérer le livre généalogique et garantir la pureté de la race.

Aujourd'hui : Le Burguete est classé comme « Race Autochtone en Danger d'Extinction ». Des programmes de conservation stricts sont en place pour préserver ce patrimoine vivant unique, qui joue également un rôle crucial dans l'entretien des pâturages de haute montagne.