Il sert de « substitut écologique » au Tarpan disparu. Dans les grands projets de restauration de la nature sauvage en Europe, il joue le rôle du grand herbivore nécessaire à l'équilibre des écosystèmes.

Présent dans de nombreux zoos, il sert de support pédagogique pour expliquer l'histoire des équidés et les concepts de génétique et de rétro-sélection.

Quelques passionnés utilisent le cheval de Heck pour la randonnée ou l'attelage léger en raison de sa robustesse exceptionnelle, mais cela reste anecdotique par rapport à ses effectifs en milieu naturel.

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