Le Cheval de Megève est issu du croisement entre des juments de race Comtois et des étalons Franches Montagnes.

Il s'agit d'une tentative de reconstitution du Cheval de Megève originel au cours des années 1995.

Considéré comme étant vulnérable, le Cheval de Megève avait un effectif de 150 individus, selon le recensement de l'année 2018.