Le pays est intimement lié aux origines du Medjimurje, une race de chevaux de trait habiles proche de l'extinction, du Poney de l'Île de Krk, une variété de poney sans doute éteinte, et du Posavac, une race influencée par des chevaux asiatiques, arabes et ibériques.
En ce qui concerne l'élevage, on peut citer le Cheval de Montagne Bosniaque, une race établie avec plusieurs lignées, le Lipizzan, le parfait exemple du cheval d'équitation baroque, le Frison, qui fait partie du patrimoine culturel des Pays Bas, et le Pur Sang, la plus rapide race du monde sur de courtes distances.
Au cours de la guerre de l'ex-Yougoslavie, qui a également touché la Bosnie Herzégovine, la Croatie a vu sa population équine diminuer de 65 %, en effet, de 190 milles individus en 1970, l'effectif est passé à seulement 10 milles en 2001. Selon le recensement de l'année 2018, l'effectif de la population équine était de 23898 individus, contre 23209 en 2017, et la population asine était de 2047 sujets, en 2018, contre 3252 en 2017.