Le Ferghana est né de la volonté d'obtenir dès le premier millénaire avant notre ère un cheval plus grand que ceux qui existait alors en Chine, plus particulièrement à l'époque de la dynastie Han qui souhaite ouvrir la route de la soie. Les races alors disponibles n'étaient pas en mesure de porter un homme en armure.
Nommé « cheval céleste » et provenant de la vallée de Ferghana, d'où son nom, ce cheval aurait été importé en très grand nombre jusqu'à ce que les élevages décident d'arrêter ces échanges, ce qui engendrera une guerre. Après les combats, un accord fut trouvé, et les éleveurs acceptèrent d'envoyer à l'empereur deux chevaux par an. Mais cela n'est qu'une théorie, parmi d'autres, de l'origine et de l'histoire du Ferghana.
En 2010, un homme d'affaire, qui souhaite élever des chevaux spécialisé avec une histoire longue de plusieurs milliers d'années, va présenter une race sous le nom de « cheval de Ferghana ». Ce cheval, ressemble un peu à Akhal Téké et au Turkmène, peut être vendu jusqu'à 6 millions de yuans aux enchères aux nouveaux riches chinois qui souhaitent démontrer leur goût pour les modes de vie aristocratiques.