Le Haut Iénisseï, ou Verkhne Eniseiskaya en russe, n'est pas une race à proprement parler, mais une variété du Trait de Touva, ce dernier étant aujourd'hui éteint. Originaire de Russie, il tire son nom russe de l'un des trois grands fleuves de Sibérie qui se jette dans l'Océan Arctique.

Lorsque les Russes des steppes de l'Altaï se sont installés dans cette région dans les années 1860, ils sont venus avec leurs chevaux de race Kuznetsk, Trotteur Russe et Trait Russe. Ces chevaux ont été élevé ensemble jusqu'en 1893, et à partir de cette date et jusqu'en 1993, ils ont été croisés avec des juments indigènes de race Touva et Mongol.