Île de Yonaguni, île qui a une altitude comprise entre 0 et 143 mètres au dessus du niveau de la mer, abritent de nombreuses ruines et reliques historiques, comme la forteresse Shengbicheng à laquelle l'armée de la dynastie Song a résisté à l'attaque mongole pendant 34 ans, la grotte en pierre à FubaoTown et le Cercueil de la dynastie Han.
Le territoire s'étale sur 28,91 kilomètres carrés, pour une population de 1684 habitants, selon le recensement de l'année 2009. Yonaguni, son chef lieu, est à une distance, à vol d'oiseau, de 2030 kilomètres de Tokyo, la capitale du pays.
Cette île, située au sud est du Japon en Asie de l'Est, est liée aux origines du Yonaguni.