Présent à l'Est de l'île du même nom en Indonésie, plus particulièrement dans la zone de Semeru, le Java est une race très ancienne qui appartient au groupe des poneys du sud est asiatique.

Il est issu de chevaux mongols arrivés à Java au cours du VIIème siècle qui ont été croisés avec des chevaux chinois introduits six siècles plus tard. Lorsque que la Compagnie hollandaise des Indes orientales, l'un des piliers de la puissance du capitalisme et de l'impérialisme néerlandais, sera présente dans le pays, elle va intervenir dans le développement de la race, en effectuant des croisements avec l'Arabe et le Barbe.

Il est très proche d'une autre race présente à Java Barat, le Kuningan.