Originaire de la province du Fujian Sheng au sud est de la Chine, le Jinjiang est une race ancienne, qui pourrait avoir un millier d'années et qui aurait une ascendance Arabe de part le port de sa queue lorsqu'il est au galop. Génétiquement parlant, il appartient au groupe des poneys du Sud de la Chine, il est donc apparenté au Bose, au Debao, au Wenshan, au Guizhou, au Luoping, au Lichuan et au Dali. Le Jinjiang a la particularité de ne pas avoir eu de nom spécifique jusqu'à la fin du XXème siècle, il était généralement désigné comme le cheval taïwanais de la côte.
Comme beaucoup d'autres races, le Jinjiang à beaucoup souffert lors de la généralisation de la mécanisation. Le déclin sera tel, que le gouvernement offrira des subventions aux éleveurs de la race. Elle sera aussi officiellement enregistrée dans le registre national de conservation des ressources génétiques animales en 2006, et deux ans plus tard, une aire protégée lui sera dédiée.