L'histoire du Karabakh remonte à l'Antiquité, se développant sur le plateau du Karabakh, entre les fleuves Araxe et Koura.

Un carrefour génétique : La race est issue d'un mélange complexe entre les chevaux indigènes du Caucase et les chevaux orientaux (Arabes, Persans, Akhal-Teke et Turkoman). Cette fusion a créé un cheval unique, alliant la finesse des chevaux du désert à la robustesse des chevaux de montagne.

La signature « Sarilar » : Très tôt, la sélection s'est portée sur une caractéristique rare : une robe alezane ou baie dotée d'un reflet métallique doré exceptionnel, héritage probable des chevaux turkmènes.

La race a atteint son apogée sous le règne des Khans du Karabakh, notamment Panah Ali Khan et ses successeurs.

Les Haras des Khans : Au XVIIIe siècle, le Khanat est devenu le centre d'élevage le plus réputé de la région. Les Khans possédaient des milliers de chevaux et pratiquaient une sélection rigoureuse. Les chevaux Karabakh étaient alors divisés en plusieurs lignées célèbres, dont la lignée Maymun et la lignée Tokhmak.

Une renommée mondiale : Au XIXe siècle, la race a commencé à s'exporter. En 1867, l'étalon Karabakh nommé Khan a remporté une médaille d'argent à l'Exposition Universelle de Paris, impressionnant les Européens par sa beauté et son endurance.

Influence sur les races russes : Le Karabakh a joué un rôle crucial dans l'amélioration de la cavalerie russe. Il est l'un des ancêtres majeurs du Cheval du Don, à qui il a transmis sa couleur dorée caractéristique et sa frugalité.

Le début du XXe siècle a failli être fatal à la race en raison des guerres civiles et des bouleversements politiques.

La chute des effectifs : En 1921, après l'effondrement du Khanat et l'intégration à l'URSS, les effectifs étaient tombés à un niveau critique.

Le Haras d'Agdam (1948) : Pour sauver ce patrimoine, les autorités soviétiques ont fondé le haras d'État d'Agdam en 1948. Grâce à une recherche minutieuse des derniers spécimens de race pure à travers le pays, la race a pu être stabilisée. L'étalon Zaman est devenu célèbre durant cette période, ayant été offert en cadeau à la reine Élisabeth II en 1956.

L'histoire récente du Karabakh est marquée par le conflit du Haut-Karabakh.

L'évacuation sous le feu : En 1993, lors de la prise d'Agdam, les éleveurs azéris ont dû évacuer les chevaux du haras alors que les combats faisaient rage. Les chevaux ont été déplacés de refuge en refuge dans des conditions précaires, perdant une partie de leur patrimoine génétique.

Un symbole de reconstruction : Malgré les pertes, le gouvernement azerbaïdjanais a investi massivement dans la préservation de la race. De nouveaux haras modernes ont été construits (comme celui de Hamad dans la région d'Aghjabadi) pour assurer la survie du « Golden Horse ».