Originaire du comté de Kerry en Irlande, le Kerry Bog est probablement issu du poney Celte présent dans les Asturies, qui ont été introduits dans le pays suite aux liens commerciaux et militaires entre l'Espagne et l'Irlande. En 1842, David Low cite des petits poneys locaux qui vivent dans le Kerry et un siècle plus tard, en 1962, Kevin Danaher l'évoque dans son utilisation pour le transport de la Tourbe.

Employé pendant plusieurs siècles dans les exploitations familiales dans les montagnes et les vallées du Kerry, il était connu sous le nom de « Hobbie ». On pense que ce nom est un dérivé de la pratique qui consistait à appeler ces poneys « Hup Hup » en langue gaélique. Cette manière de le faire venir est surnommée « obaireacht ». Le nom actuel de « Kerry Bog » démontre les qualités de son environnement de vie et de son travail.

Comme beaucoup d'autres races irlandaises, il a été employé par les militaires pendant les guerres péninsulaires, de 1804 à 1814, et aussi pendant la Première Guerre Mondiale de 1914 à 1918. L'effectif a considérablement diminué durant cette période où le Kerry Bog a été privé de son habitat naturel. Par la suite la généralisation de la mécanisation et l'évolution du mode de vie à continuer d'ébranler le cheptel. Malgré la création du Stud-book en 2005 et de l'association, il ne parviendra pas a redevenir aussi florissant qu'autrefois, et de nos jours la race est considérée comme en danger d'extinction.