Développé à partir de l'année 1812, le Mecklembourg est une race qui a vu principalement le jour dans des haras allemand, sans qu'il y ait un programme d'élevage établi. Il est né au XVIIIème siècle, par la volonté de posséder un cheval capable de servir pour la cavalerie, à l'attelage, mais aussi à l'équitation traditionnelle.

Il est issu des chevaux locaux, qui après une sélection par les comtes de Plessen, va être influencé par l'Arabe et le Turkmène. Très vite, le Pur Sang va contribuer à son élaboration, mais son implication va affecter les caractéristiques précieuses de la race, comme sa solidité et sa longévité. C'est avec l'intervention du Hanovrien, dont il est très proche, que le Mecklembourg va s'approcher du type recherché, avec un apport du Trakehner.

Le but principal de l'élevage, reste aujourd'hui le même, et cela depuis 1970, avoir un bon cheval de selle qui possède les bonnes qualités sportives.