Aujourd'hui, la sélection est supervisée par l'Institut de recherche agricole d'Arkhangelsk. Les éleveurs cherchent à maintenir la pureté de la race tout en améliorant légèrement la taille pour répondre aux besoins modernes.

La race est considérée comme étant en péril en raison de la diminution des effectifs. Des programmes de conservation génétique ont été mis en place pour éviter les croisements excessifs avec des chevaux de trait lourds, ce qui ferait perdre au Mezen sa capacité légendaire à se déplacer dans la neige.

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