Développé à partir de 1965 à l'occasion de la réunion annuelle du « Groupe de travail des associations d'éleveurs de poneys » à Bad Harzburg, le Poney de Selle Allemand a été sélectionné afin d'obtenir une modèle du type du « Riding Pony » britannique. Les éleveurs allemands souhaitaient créer un poney qui avait les qualités d'un cheval d'équitation, et l'objectif d'élevage a été atteint en à peine 6 à 10 ans.

Son histoire débute par une sélection non aboutie où le Pur Sang, le Fjord, l'Arabe et l'Haflinger ont été utilisés. Ensuite, autour de 1975, l'élevage de poneys s'est établi dans les états de Rhénanie du Nord-Westphalie, de Basse-Saxe, de Hanovre ainsi que dans le Schleswig-Holstein, avec le Dülmen et des races comme le Welsh B, le New Forest et le Connemara. Majoritairement influencé par ces derniers et par le Welsh, le Poney de Selle Allemand a aussi été croisé, au cours de son développement, avec l'Arabe, le Pur Sang et l'Anglo-arabe.

Au début des années 1990, des tentatives d'amélioration, dans plusieurs associations d'élevage, avec des étalons à sang chaud comme le Trakehner, le Hanovrien et le Holstein, ont eu un résultat en demi-teinte, à cause de l'éloignement du type poney.

Race considérée comme non menacée, le Poney de Selle Allemand bénéficie d'une grande popularité, qui permet à ses effectifs de rester stables.

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