Développée aux États Unis par la famille Boomhower dans l'État de l'Iowa au cours des années 1950, le Poney des Amériques est une des races les plus récentes du monde et constitue aussi l'une des plus populaire du pays. Tout a commencé avec la jument Manitoba issue d'un Arabe et d'un Appaloosa et un étalon Shetland, qui vont devenir les parents du père fondateur de la race, nommé Black Hand, en raison d'une marque sur sa robe qui évoque une main noire.

Souhaitant développer ce nouveau type de poney, Leslie Boomhower et un groupe d'éleveurs fondent en 1954, en même temps que le registre, l'association « Pony of the Americas Club ». C'est Black Hand qui sera enregistré en premier et le second sera Siri Chief. Suivra ensuite Na-Na Su-kin, un cheval Nez-Percés originaire du Montana, qui adoptera le nom de Little Chief, puis Scottish Chieftain, un poney tacheté, Dragon, un étalon Mustang sauvage en provenance du Mexique et enfin Stewart's Danny Boy d'origine anglaise. Dans les années qui vont suivre, la popularité de la race ne va cesser d'augmenter de plus en plus.

Après avoir fixé la race au moyen de croisements avec l'Arabe, l'Appaloosa, le Quarter Horse et le Welsh, dans l'objectif de développer une monture pour les enfants et les petits adultes avec une robe tachetée, la taille, qui était auparavant comprise entre 1,10 mètre et 1,30 mètre en 1963, va être de 1,20 mètre à 1,40 mètre, pour enfin être limitée en 1985 à 1,40 mètre. L'admission se fera sur candidature où les nouveaux individus, ne sont pas immédiatement enregistrés, mais placés sur une liste d'attente, en attendant la vérification de la conformité du standard et de la qualité de ses performances.

De nos jours le Poney des Amériques est une race qui n'est pas à risque, car son registre est l'un des plus grands de tous ceux destinés à l'équitation pour les enfants.