Traditionnellement, les poneys vivent en semi-liberté. Ils paissent dans les plaines d'inondation durant la saison sèche et sont regroupés près des villages pendant la saison des pluies pour éviter les prédateurs.

Il n'existe pas d'élevage structuré de Poney du Logone en dehors de l'Afrique centrale. La race est considérée comme en danger par la FAO.

Le principal risque est le métissage avec des chevaux de type Barbe ou Arabe-Barbe (plus grands), introduits pour augmenter la taille des produits mais qui perdent, en une génération, la trypanotolérance spécifique à la race.

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