Pouilly en Auxois, commune rurale qui a une altitude comprise entre 369 et 560 mètres au dessus du niveau de la mer, se trouvait au XVIème siècle dans les hauteurs, pour ensuite être déplacée, petit à petit, vers la vallée, quand les fortifications des châteaux du Duc de Bourgogne devinrent inefficaces.
Le territoire s'étale sur 10,12 kilomètres carrés, pour une population de 1509 habitants, selon le recensement de l'année 2018. Paris, la capitale du pays, est à une distance, à vol d'oiseau, de 241 kilomètres de son centre géographique.
Cette commune rurale, située à l'ouest de la France en Europe de l'Ouest, abrite un organisme de race, l'« Union Nationale du Cheval Trait Auxois ».