La Région de Tombouctou se trouve à la limite sud du Sahara, près du fleuve Niger, possédant des sources dans les hauts plateaux très près de la côte de l'Océan Atlantique.

Le territoire s'étale sur 497926 kilomètres carrés, pour une population de 681691 habitants, selon le recensement de l'année 2009. Tombouctou, son chef lieu, est à une distance, à vol d'oiseau, de 706 kilomètres de Bamako, la capitale du pays.

Cette région, située au nord du Mali en Afrique Subsaharienne, est liée à l'élevage du Songhoï.