Descendant direct de l'étalon « Tobe », provenant des Montagnes Rocheuses des Appalaches, puis amené dans le Kentucky vers les années 1890, le Rocky Mountain Horse, dont l'histoire est très similaire à celle du Kentucky Moutain Saddle Horse, est issu du croisement entre « Tobe » et des juments locales ayant probablement des origines liées aux Narragansett Pacer, du fait de son allure supplémentaire, mais aussi au Cheval Colonial Espagnol originel.
C'est Sam Tuttle, le propriétaire de l'étalon « Tobe », qui a permis à la race de subsister aux différentes crises, comme la Grande Dépression et la Seconde Guerre Mondiale, de 1939 à 1945. En effet, contrairement à la majorité des races, qui ont vu leur effectif décliner au cours du XXème siècle, le Rocky Mountain Horse n'a pas été affecté et a continuer à se reproduire grâce à la contribution de « Tobe » et les bons soins de Sam Tuttle. Lors de la création du Stud-book et de la « Rocky Mountain Horse Association » en 1986, 26 individus furent enregistrés.
Signalé « à surveiller » en 2012 par l'American Livestock Breeds Conservancy, le Rocky Mountain Horse est considéré comme étant à risque. Toutefois son effectif d'environ 15000 individus, lui promet un bel avenir, d'autant que la race est, de nos jours, présente à l'étranger, en Asie, en Europe et en Afrique du Nord.