Samothrace, île qui a une altitude comprise entre 0 et 1611 mètres au dessus du niveau de la mer, s'étend au coeur de la baie de Saros, dans la mer de Thrace, au nord est de la mer Égée, sur des montagnes escarpées, sur un littoral en grande partie plat et des plages de galets et de sable, comme celles de Pachia Ammos et Vatos.
Le territoire s'étale sur 180364 kilomètres carrés, pour une population de 2859 habitants, selon le recensement de l'année 2011. Le climat est méditerranéen, selon la classification de Koppen, fondée sur les précipitations et les températures. Samothrace, une des plus grandes villes l'île, est à une distance, à vol d'oiseau, de 317 kilomètres d'Athènes, la capitale du pays.