Race locale ressemblant fortement au Bouriate, avec lequel il est souvent classé, le Transbaïkal, est sans doute issu du croisement entre le Mongol et le Yakoute, en référence avec la marque primitive qu'il porte souvent sur son épaule.
Populaire auprès des cosaques sous l'empire Russe, le Transbaïkal est une race ancienne et rare, qui a fortement souffert des nombreux croisements qu'il a subit. Toutefois le niveau de menace n'est pas connu, faute de recensement de sa population, qui est estimé à environ 300 individus.