Descendant des chevaux qui ont été introduits sur le continent américain par les conquistadors, le Trotteur Cubain, nommé aussi « Cuban trotter », est une race issue du Criollo, et probablement du cheval Canadien, arrivé sur le territoire pour travailler dans les plantations de canne à sucre avant la Révolution américaine, une période de changements politiques qui a pris fin en 1763. Pour finir, il a ensuite été influencé par le Morgan.

Le niveau de menace du Trotteur Cubain est inconnu, tout comme son effectif, aucun recensement n'étant disponible.