L'histoire commence avant même la création de la Yougoslavie, lorsque la Serbie septentrionale (Voïvodine) faisait partie de l'Empire austro-hongrois.

1891 : Le point de départ. C'est à cette date que sont organisées les premières courses de trot officielles à Subotica, une ville qui reste encore aujourd'hui la capitale du trot serbe. À l'époque, les chevaux étaient des métis issus de races locales (comme le Nonius) croisés avec des trotteurs importés de Hongrie et d'Autriche.

Influence des Orlov : Les premiers éleveurs se tournent vers la Russie pour importer des Trotteurs Orlov, réputés pour leur élégance et leur endurance, afin d'affiner les chevaux de ferme locaux et d'en faire des chevaux d'attelage rapides.

Avec la formation du Royaume de Yougoslavie, le trot s'organise et se professionnalise.

L'arrivée du Standardbred : C'est durant cette période que les premiers étalons Standardbreds (trotteurs américains) font leur apparition. Leur influence est immédiate : ils apportent une vitesse de pointe et une précocité qui manquaient aux lignées Orlov.

Développement des hippodromes : Des pistes sont construites à Belgrade, Pančevo et Ada, créant un véritable circuit de compétition qui stimule l'élevage privé et aristocratique.

Après la Seconde Guerre mondiale, sous le régime de la République fédérative socialiste de Yougoslavie, l'élevage prend une dimension nationale et structurée.

La création du Haras de Zobnatica : Ce haras historique, situé près de Bačka Topola, devient le centre névralgique de l'élevage. On y sélectionne les meilleurs individus sous le nom de « Trotteur Yougoslave ».

L'influence américaine prédominante : Pour hisser le Trotteur Yougoslave au niveau international, les autorités importent massivement des étalons et des poulinières des États-Unis et d'Italie (pays leader du trot à cette époque). La race se transforme alors en une population très proche du Standardbred américain, tout en conservant une certaine rusticité locale pour s'adapter aux pistes des Balkans.

La dissolution de la Yougoslavie et les guerres des années 1990 ont durement touché l'élevage équin.

La survie du cheptel : Malgré les difficultés économiques et l'embargo, les éleveurs serbes (notamment en Voïvodine) ont réussi à préserver les lignées fondamentales.

Le Trotteur de Serbie : Aujourd'hui, bien que le nom historique de « Trotteur Yougoslave » soit encore utilisé dans de nombreux pedigrees, la race est officiellement gérée par l'Association des Éleveurs de Trotteurs de Serbie (Udruženje odgajivača kasačkih konja Srbije).

Modernisation génétique : Le stud-book reste ouvert aux apports de sang français et américain pour maintenir la compétitivité des chevaux serbes qui s'illustrent régulièrement dans les pays voisins (Hongrie, Slovénie, Italie).