Structure très compliquée, développée en se recourbant sur lui-même, le gros intestin, qui correspond à environ 60% du volume total.

Il est composé du cæcum, du côlon ascendant, du côlon descendant et du rectum.

Le caecum, qui est une poche en cul de sac, a pour rôle le tri des particules dont les plus grosses résident moins longtemps que celles inférieurs à 10 millimètres.

Le côlon ascendant est un tube long et replié en quatre parties avec des diamètres qui diffèrent, et où les aliments séjournent plutôt longtemps.

Le côlon descendant, et le rectum, sont des parties non fixées capables de se déplacer de manière importante.

Suivant la composition de la ration, le temps approximatif du transit total dans le gros colon est de 24 à 48 heures, en sachant qu'il se fait plus rapidement pour les aliments avec peu de fibres comme l'herbe de printemps.

Pour la dégradation des aliments, plus particulièrement des fibres, le gros intestin utilise de nombreux micro-organismes, dont le nombre et la composition est relatif à la nature de son alimentation.

C'est à ce niveau que tout ce qui n'a pas été digéré précédemment, le sera ici par fermentation, comme les fibres composant les glucides pariétaux.

Les « restes » d'amidon et de protéines, non digérés par l'intestin grêle, vont être digérés en acide gras volatils, absorbés pour ensuite fournir de l'énergie au cheval.

Par contre, les acides aminés et les matières azotées présentes dans le gros intestin seront peu valorisés, et pire, ils peuvent être transformés en ammoniaque, qui a forte dose, devient toxique, et provoque différentes pathologies.

Zone d'absorption du phosphore et de la suppression de l'eau, le gros intestin est un organe qu'il est indispensable de considérer dans la ration quotidienne.

Les microbes présent dans le gros intestin sont particulièrement sensibles à la modification de la ration, car ils sont spécifiques de chaque aliment.

C'est la raison pour laquelle il faut prévoir une période de transition lors de la modification de l'alimentation, afin de permettre à la flore microbienne de s'adapter.

Le cheval est prédisposé aux coliques par constipation, à cause de la forme du côlon, il faut donc être prudent et éviter la surconsommation de paille.

Des risques d'acidose et des nuisances au niveau de la flore microbienne, qui implique une digestion moins performante, des coliques, des diarrhées, la fourbure et les myosites, peuvent se présenter à la suite de la dégradation de l'amidon en acide gras volatil.

Il faut donc anticiper afin que les rations riches en amidon, comme les céréales, puissent rester le temps nécessaire dans l'intestin grêle de manière à ce que celui-ci puissent correctement procéder à la dégradation, en distribuant, par exemple, du foin avant les aliments composés, ou concentrés et en répartissant les repas pour que les rations ne soient pas trop grandes.