L'histoire du cheval Amourski commence véritablement au milieu du XIXe siècle, lors de l'expansion russe vers l'océan Pacifique. Pour sécuriser ces vastes territoires, le gouvernement tsariste y installa les Cosaques de l'Amour.

Ces colons militaires arrivèrent avec leurs propres montures, principalement des chevaux de Transbaïkalie (une race proche du cheval mongol). Une fois installés dans la région de l'Amour, ces chevaux furent croisés avec des populations locales de type mandchou et sibérien, jetant les bases d'une nouvelle souche capable de survivre dans un environnement particulièrement hostile.

Contrairement aux steppes sèches d'Asie centrale, la région de l'Amour est caractérisée par un climat humide, des hivers glaciaux et, surtout, de vastes zones marécageuses infestées d'insectes en été.

Il a développé un pied extrêmement sûr pour traverser les tourbières et les taïgas denses.

Sa sélection s'est faite sur l'endurance pure plutôt que sur la vitesse, car il devait parcourir des distances colossales sans ravitaillement régulier.

Il est devenu célèbre pour sa capacité à se nourrir de fourrages pauvres (joncs, écorces) que des chevaux européens auraient refusés.

L'événement le plus marquant de l'histoire de la race est sans doute l'épopée du cosaque Dimitri Pechkov. En novembre 1889, pour prouver la valeur des chevaux de sa région, il entreprit un voyage incroyable de Blagovechtchensk à Saint-Pétersbourg.

Accompagné de son petit cheval gris nommé Serko (un type Amourski - Transbaïkal), il parcourut près de 9 000 kilomètres en moins de 200 jours, par des températures atteignant -40°C. Cet exploit stupéfia la cour impériale et démontra au monde entier que le cheval Amourski possédait une résistance physiologique dépassant l'imagination.

Au début du XXe siècle, face aux besoins croissants de l'armée et de l'agriculture, des tentatives d'amélioration furent entreprises. Des étalons Orlov, Don et même des chevaux de trait furent introduits pour augmenter la taille et la force de traction de l'Amourski original.

Pendant l'ère soviétique, la race a été utilisée massivement pour les travaux forestiers et la garde des frontières. Cependant, la mécanisation et les croisements à grande échelle ont progressivement dilué le type ancien. Le cheval Amourski a souvent été absorbé dans des dénominations plus larges comme le « Cheval de trait de l'Extrême-Orient ».

Aujourd'hui, le cheval Amourski dans sa forme pure est devenu rare. Il survit principalement dans les exploitations rurales reculées de la région de l'Amour et de Khabarovsk. Bien que moins médiatisé que d'autres races russes, il reste un symbole de la conquête de l'Est et un exemple fascinant d'adaptation d'un animal domestique à un écosystème extrême.